Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BHLHE41Q9C0J9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms