Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CIPCQ9C0C6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIPCQ9C0C6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms