Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms