Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NLRP1Q9C000 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms