Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PUS3Q9BZE2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PUS3Q9BZE2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS3Q9BZE2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms