Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPEB1Q9BZB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPEB1Q9BZB8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms