Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11FIP5Q9BXF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms