Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms