Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KATNB1Q9BVA0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KATNB1Q9BVA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms