Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms