Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FYCO1Q9BQS8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FYCO1Q9BQS8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FYCO1Q9BQS8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms