Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNS3Q9BQ31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNS3Q9BQ31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms