Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL2Q99962 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3GL2Q99962 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms