Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPAS2Q99743 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms