Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP8Q99708 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms