Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF6Q99612 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF6Q99612 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms