Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP4Q99569 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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