Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMD1Q99460 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD1Q99460 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms