Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNKPQ96T60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms