Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN18Q96SJ8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms