Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC85AQ96PX6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms