Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM3Q96PE6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms