Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD11Q96NU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD11Q96NU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms