Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RDH12Q96NR8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH12Q96NR8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms