Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms