Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRELID3AQ96N28 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRELID3AQ96N28 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms