Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms