Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NSMCE2Q96MF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms