Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC114Q96M63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms