Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNBD2Q96M20 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNBD2Q96M20 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms