Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RMDN2Q96LZ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN2Q96LZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms