Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC17Q96LX7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms