Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6LQ96LI5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT6LQ96LI5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6LQ96LI5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms