Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP8Q96LD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP8Q96LD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms