Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM47Q96LD4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms