Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
LINC00208Q96KT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LINC00208Q96KT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms