Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms