Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPTM1LQ96KA5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPTM1LQ96KA5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms