Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCHS1Q96JQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms