Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NEURL4Q96JN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEURL4Q96JN8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms