Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC136Q96JN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC136Q96JN2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms