Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIC2Q96JB3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms