Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC22AQ96IW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms