Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPNQ96H22 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPNQ96H22 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPNQ96H22 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms