Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCD1Q96GM5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD1Q96GM5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms