Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCMH1Q96GD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCMH1Q96GD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms