Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTV1Q96GA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTV1Q96GA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms