Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BICD1Q96G01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BICD1Q96G01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms