Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEIL1Q96FI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms