Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TVP23CQ96ET8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23CQ96ET8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms